hCocena: Integrative Co-Expression Netzwerk-Analyse
hCocena ist ein fortschrittliches R-Paket zur netzwerkbasierten Co-Expressionsanalyse von Transkriptomdaten. Es unterstützt die Analyse einzelner und mehrerer Datensätze, wodurch umfassende integrative Analysen über verschiedene Bedingungen hinweg ermöglicht werden. hCocena erleichtert die Erkennung von Co-Expressionsmustern, Netzwerkintegration und funktionelle Analyse mit einer benutzerfreundlichen und anpassbaren Oberfläche. Das Paket umfasst umfangreiche Dokumentation und Beispiel-Workflows, was es für Nutzer mit unterschiedlichem Programmierwissen zugänglich macht.
Für weitere Informationen und Zugriff auf das Paket besuchen Sie hCocena auf GitHub.
Marie Oestreich, Lisa Holsten, Shobhit Agrawal, Kilian Dahm, Philipp Koch, Han Jin, Matthias Becker, Thomas Ulas, hCocena: horizontal integration and analysis of transcriptomics datasets, Bioinformatics, Volume 38, Issue 20, 15 October 2022, Pages 4727–4734, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac589
Lisa Holsten, Kilian Dahm, Marie Oestreich, Matthias Becker, Thomas Ulas,
hCoCena: A toolbox for network-based co-expression analysis and horizontal integration of transcriptomic datasets, STAR Protocols, Volume 5, Issue 1, 2024, doi.org/10.1016/j.xpro.2024.102922.