hCocena: Integrative Co-Expression Netzwerk-Analyse
hCocena ist ein fortschrittliches R-Paket zur netzwerkbasierten Co-Expressionsanalyse von Transkriptomdaten. Es unterstützt die Analyse einzelner und mehrerer Datensätze, wodurch umfassende integrative Analysen über verschiedene Bedingungen hinweg ermöglicht werden. hCocena erleichtert die Erkennung von Co-Expressionsmustern, Netzwerkintegration und funktionelle Analyse mit einer benutzerfreundlichen und anpassbaren Oberfläche. Das Paket umfasst umfangreiche Dokumentation und Beispiel-Workflows, was es für Nutzer mit unterschiedlichem Programmierwissen zugänglich macht.
Für weitere Informationen und Zugriff auf das Paket besuchen Sie hCocena auf GitHub.
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Marie Oestreich, Lisa Holsten, Shobhit Agrawal, Kilian Dahm, Philipp Koch, Han Jin, Matthias Becker, Thomas Ulas, hCocena: horizontal integration and analysis of transcriptomics datasets, Bioinformatics, Volume 38, Issue 20, 15 October 2022, Pages 4727–4734, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac589
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Lisa Holsten, Kilian Dahm, Marie Oestreich, Matthias Becker, Thomas Ulas,
hCoCena: A toolbox for network-based co-expression analysis and horizontal integration of transcriptomic datasets, STAR Protocols, Volume 5, Issue 1, 2024, doi.org/10.1016/j.xpro.2024.102922.